Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Runx1t1-202ENSMUST00000098256 3317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hdac5Q9Z2V6 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hdac5Q9Z2V6 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms