Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gtf3c6Q9D8P7 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms