Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Top1mtQ8R4U6 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms