Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ccdc28aQ8CEI3 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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