Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nup88Q8CEC0 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms