Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg4aQ8C9S8 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Atg4aQ8C9S8 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg4aQ8C9S8 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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