Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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