Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms