Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Gm28047Q3US59 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Gm28047Q3US59 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms