Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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