Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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