Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ttc39dQ0VF76 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ttc39dQ0VF76 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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