Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ebf1Q07802 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Ebf1Q07802 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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