Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Top2aQ01320 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms