Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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