Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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VdrP48281 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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