Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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SrprbP47758 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SrprbP47758 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
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SrprbP47758 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SrprbP47758 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SrprbP47758 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SrprbP47758 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SrprbP47758 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SrprbP47758 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrprbP47758 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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