Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Brd8-204ENSMUST00000115766 4258 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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