Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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Gm2035J3QP87 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Gm2035J3QP87 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2035J3QP87 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms