Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc180J3QNE4 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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