Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cttnbp2B9EJA2 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms