Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms