Protein–RNA interactions for Protein: S4R2D1

Gm5493, Predicted gene 5493, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5493S4R2D1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5493S4R2D1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5493S4R2D1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms