Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc23a1Q9Z2J0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc23a1Q9Z2J0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms