Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne6Q9Z140 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cpne6Q9Z140 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms