Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Sh3bp5Q9Z131 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Sh3bp5Q9Z131 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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Sh3bp5Q9Z131 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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Sh3bp5Q9Z131 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5Q9Z131 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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Sh3bp5Q9Z131 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
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Sh3bp5Q9Z131 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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Sh3bp5Q9Z131 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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Sh3bp5Q9Z131 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms