Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skp2Q9Z0Z3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms