Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup160Q9Z0W3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nup160Q9Z0W3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms