Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F7

Sncg, Gamma-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncgQ9Z0F7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncgQ9Z0F7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms