Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnip1Q9WUU8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnip1Q9WUU8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms