Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn4Q9WU22 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn4Q9WU22 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms