Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TapbpQ9R233 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms