Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim3Q9R1R2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim3Q9R1R2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms