Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod1Q9R0E2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod1Q9R0E2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms