Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lamc3Q9R0B6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lamc3Q9R0B6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lamc3Q9R0B6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lamc3Q9R0B6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lamc3Q9R0B6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Lamc3Q9R0B6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc3Q9R0B6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms