Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nek3Q9R0A5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek3Q9R0A5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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