Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hacd1Q9QY80 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hacd1Q9QY80 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms