Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cbx8Q9QXV1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cbx8Q9QXV1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms