Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cml5Q9QXS8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cml5Q9QXS8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms