Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacl1Q9QXE0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacl1Q9QXE0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms