Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Limd1Q9QXD8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Limd1Q9QXD8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Limd1Q9QXD8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Limd1Q9QXD8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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