Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim44Q9QXA7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim44Q9QXA7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim44Q9QXA7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim44Q9QXA7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim44Q9QXA7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms