Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcea2Q9QVN7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms