Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrfQ9JM73 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrfQ9JM73 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms