Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cyp39a1Q9JKJ9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyp39a1Q9JKJ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms