Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Uchl3Q9JKB1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms