Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Herpud1Q9JJK5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Herpud1Q9JJK5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms