Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl28Q9JIL2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccl28Q9JIL2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccl28Q9JIL2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl28Q9JIL2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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