Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Praf2Q9JIG8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Praf2Q9JIG8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Praf2Q9JIG8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Praf2Q9JIG8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Praf2Q9JIG8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms