Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rb1cc1Q9ESK9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rb1cc1Q9ESK9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Rb1cc1Q9ESK9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms